Desde hace 10,000 años las lluvias que bañan a la sierra del Ajusco-Chichinautzin conforman un río subterráneo que va a dar al Borbollón o nacimiento del río en Las Estacas.
A lo largo de este tiempo se ha creado una biodiversidad muy importante.
En la actualidad se han detectado:
160 diferentes especies de aves acuáticas y terrestres dentro de ellos, 110 de plantas terrestres, 11 de peces, 8 de mamíferos y 3 de reptiles. Además: tortugas, cangrejos, iguanas, langostinos.

Proyectos realizados:
1. Inventario de las diferentes especies de fauna y flora que habitan en el parque.
2. Desarrollo de un estanque de 1,000 m2 de superficie, para cultivo de tilapias
3. Creación de un vivero de plantas propias de la zona, único en su tipo.
4. Capacitación de los trabajadores del parque en la colecta de semillas.
5. Capacitación de los trabajadores en cuanto al tratamiento fitosanitario de las especies vegetales.
6. Capacitación de trabajadores en cuanto al programa de conservación ambiental y sus alcances.
7. Composteo de la materia orgánica seleccionada, que satisfacen las necesidades de la jardinería del parque y del vivero
8. Reintroducción de distintas especies nativas del río,
9. Ordenamiento, poda y cultivo sistematizado de las especies vegetales más representativas.
10. Reforestación de la zona con 8,000 individuos de diferentes especies de la región.